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服务介绍:
转录组测序(mRNA-seq):基于Illumina测序平台,对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,既可以提供定量分析,检测基因表达水平差异,又可以提供结构分析,发现稀有转录本,并且对差异表达基因进行功能注释。
实验流程:样本处理-TotalRNA抽提与质检-文库构建-PE150测序-数据分析;
送样运输要求:
1)样品类型:细胞、动物新鲜组织、植物组织、全血、血清、血浆、石蜡切片、或RNA样品。
2)样品的量:新鲜动物组织 ≥100mg(含肌纤维或脂肪等组织的样品 RNA 含量较低,送样量需增加)。新鲜培养细胞 ≥5×106 个(请清洗后离心得细胞沉淀,用 TRIzol 充分裂解并干冰运输)。新鲜全血 ≥1mL(新鲜血液样本,不可使用冻存血。建议向新鲜血液中加入 3 倍体积的 TRIzol LS 裂解液,干冰运输)。血清,血浆(一般是用至少2ml的全血分离出来的量)。PBMC>1*107(加Trzol混匀,避免反复冻融)。植物组织 ≥1g(含多糖多酚等的复杂植物组织,请尽可能多的送样)。石蜡切片5-10 张/卷(未经 HE 染色的切片;厚度≥5µm;组织区域面积≥10mm×10mm;有核细胞比例>80%;肿瘤细胞比例>20%。建议使用 1 年内的 FFPE 样本)。
3)样品质量:RNA无明显降解,提取的总RNA OD260/280值在1.8~2.2之间,浓度 ≥ 500 ng/μl,28S:18S ≥ 1.5,RIN ≥ 7。
4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可用TRIZOL或RNA保护剂处理或液氮冻存后,-80℃保存。RNA样品可溶于乙醇或RNA-free的超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融。
5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。
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